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L'FC Brno II è una squadra calcistica ceca con sede nella città di Brno. È la squadra riserve dell'FC Brno, che milita nella Prima Lega ceca. L'FC Brno II gioca attualmente nella Moravian-Silesian Football League, la terza divisione del calcio ceco. Lo stadio di casa della squadra è il Za Lužánkami, che ha una capienza di 12.550 posti a sedere. I colori sociali della squadra sono il rosso e il blu.

L'FC Brno II è stata fondata nel 1953 e ha giocato nella seconda divisione del campionato cecoslovacco fino al 1994, quando è stata promossa in Prima Lega. La squadra è rimasta in Prima Lega per due stagioni, prima di essere retrocessa in seconda divisione nel 1996. Nel 2005, l'FC Brno II è stata retrocessa in terza divisione, dove gioca tuttora.

L'FC Brno II ha vinto la Moravian-Silesian Football League una volta, nel 2012. Ha anche vinto la Coppa della Moravia meridionale tre volte, nel 1979, 1980 e 2003.

Alcuni dei giocatori più famosi che hanno militato nell'FC Brno II includono Pavel Nedvěd, Jan Koller e Tomáš Ujfaluši.