L'FC Zenit Tallinn è una squadra di calcio estone con sede a Tallinn. Milita nella Meistriliiga, la massima serie del campionato di calcio estone.

Il club è stato fondato nel 1997 e ha vinto due volte il campionato estone, nel 2012 e nel 2014. Ha inoltre vinto la Coppa d'Estonia quattro volte, nel 2010, 2012, 2014 e 2016.

Lo Zenit Tallinn gioca le partite casalinghe allo Zenit Stadium, che ha una capacità di 5.000 spettatori.

I colori sociali della squadra sono il blu e il bianco.

Tra i giocatori più famosi che hanno militato nello Zenit Tallinn ci sono Konstantin Vassiljev, Sergei Zenjov e Aleksandr Dmitrijev.