L'Associazione Esportiva São Borja, comunemente nota come São Borja, è una società calcistica brasiliana con sede a São Borja, nello stato del Rio Grande do Sul. Fondata il 26 marzo 1923, gioca nel Campeonato Gaúcho Série B, il secondo livello del calcio del Rio Grande do Sul.

Il club fu fondato da un gruppo di giovani della città di São Borja, che volevano creare una squadra di calcio che rappresentasse la città. Il primo presidente del club fu João Batista de Almeida.

Il São Borja ha giocato nel Campeonato Gaúcho per la prima volta nel 1925. Il club ha vinto il campionato statale una volta, nel 1959.

Il São Borja ha anche partecipato alla Copa do Brasil, la coppa nazionale del Brasile, in quattro occasioni. Il club ha raggiunto gli ottavi di finale nel 1998.

Il São Borja è uno dei club più antichi del Brasile. È una squadra molto popolare nella città di São Borja e ha una grande base di fan.