San Antonio FC

Il 7 gennaio 2016 venne assegnato alla franchigia di San Antonio il trentunesimo ingresso nella USL. La costituzione del club, insieme con l'acquisto del Toyota Field da parte del comune di San Antonio e della contea di Bexar, era parte di un piano della Spurs Sports & Entertainment (già proprietaria della franchigia NBA dei San Antonio Spurs) per ottenere un posto nelle future espansioni della Major League Soccer. Le vicende della nuova società e dello stadio provocò, tra le altre cose, la chiusura dei San Antonio Scorpions, franchigia della North American Soccer League. Darren Powell, ex allenatore della squadra di calcio dell'università di Elon nonché ex direttore del vivaio dell'Orlando City, fu nominato primo allenatore della storia del club. Il 2 febbraio 2016, invece, la società annunciò l'ingaggio del suo primo calciatore, il centrocampista statunitense ex Chivas USA Carlos Alvarez.

Dopo una prima stagione di ambientamento, nel 2017 la squadra, che nel frattempo per quell'anno aveva stretto un accordo di affiliazione con il New York City, concluse la stagione regolare al secondo posto della Western Conference, qualificandosi così per la post-season per la prima volta nella sua storia. In seguito alla vittoria al primo turno contro i Tulsa Roughnecks, però, i rossoneri dovettero cedere il passo nella semifinale di conference all'OKC Energy dopo i calci di rigore.

Il 30 novembre 2019 Darren Powell ed il club decisero consensualmente di non proseguire il rapporto di lavoro. Di conseguenza, il 9 dicembre successivo, l'ex allenatore in seconda Alen Marcina, già sulla panchina dei San Antonio Scorpions, fu nominato nuovo allenatore. Alla sua prima stagione alla guida della squadra, Marcina riuscì a portare nuovamente, dopo tre anni, il San Antonio ai playoff, dove fu però eliminato al primo turno dal New Mexico United con il risultato di 1-0.