L'MFK Mykolaïv (in ucraino Муніципальний футбольний клуб Миколаїв?) è una società di calcio di Mykolaïv, in Ucraina. Milita in Druha Liha, la terza serie del campionato ucraino di calcio.
Nel 1992 prese parte alla prima edizione della Prem"jer-liha ucraina, finendo retrocesso. Nel 1998 vinse il campionato di Perša Liha. Nel 2006 e nel 2011 vinse il campionato di Druha Liha.
In Coppa d'Ucraina il miglior piazzamento sono stati gli ottavi, fino all'edizione 2016-17 nella quale ha raggiunto le semifinali.