L'FC Milenium Apostolovo è una squadra di calcio bulgara con sede ad Apostolovo, che milita nella V AFG, la quinta divisione del campionato bulgaro di calcio.
La squadra è stata fondata nell'estate del 2005 da un gruppo di appassionati di calcio locali. L'obiettivo iniziale era quello di creare una squadra di calcio che potesse rappresentare la città di Apostolovo e che potesse competere con le altre squadre della regione.
Nei primi anni di attività, l'FC Milenium Apostolovo ha partecipato ai campionati regionali di Veliko Tarnovo. Nel 2010, la squadra ha ottenuto la promozione in quarta divisione, dopo aver vinto il campionato regionale.
Nella stagione 2010-2011, l'FC Milenium Apostolovo ha esordito in quarta divisione, ottenendo il sesto posto nel proprio girone. Nella stagione successiva, la squadra ha migliorato il proprio piazzamento, ottenendo il quarto posto.
Nel 2012, l'FC Milenium Apostolovo ha ottenuto la promozione in terza divisione, dopo aver vinto gli spareggi promozione. Nella stagione 2012-2013, la squadra ha esordito in terza divisione, ottenendo il nono posto nel proprio girone.
Nella stagione 2013-2014, l'FC Milenium Apostolovo ha ottenuto il settimo posto nel proprio girone di terza divisione. Nella stagione successiva, la squadra ha migliorato il proprio piazzamento, ottenendo il quinto posto.
Nel 2015, l'FC Milenium Apostolovo ha ottenuto la promozione in seconda divisione, dopo aver vinto gli spareggi promozione. Nella stagione 2015-2016, la squadra ha esordito in seconda divisione, ottenendo il quindicesimo posto nel proprio girone.
Nella stagione 2016-2017, l'FC Milenium Apostolovo ha ottenuto il sedicesimo posto nel proprio girone di seconda divisione, retrocedendo così in terza divisione.
Nella stagione 2017-2018, l'FC Milenium Apostolovo ha ottenuto il nono posto nel proprio girone di terza divisione. Nella stagione successiva, la squadra ha ottenuto il sesto posto.
Nel 2019, l'FC Milenium Apostolovo ha ottenuto la promozione in seconda divisione, dopo aver vinto gli spareggi promozione. Nella stagione 2019-2020, la squadra ha esordito in seconda divisione, ottenendo il quattordicesimo posto nel proprio girone.
Nella stagione 2020-2021, l'FC Milenium Apostolovo ha ottenuto il quindicesimo posto nel proprio girone di seconda divisione, retrocedendo così in terza divisione.
Nella stagione 2021-2022, l'FC Milenium Apostolovo ha ottenuto l'undicesimo posto nel proprio girone di terza divisione. Nella stagione corrente, la squadra sta partecipando al campionato regionale di Veliko Tarnovo.
L'FC Milenium Apostolovo è una squadra ambiziosa che punta a tornare in seconda divisione nel più breve tempo possibile. La squadra può contare su un gruppo di giocatori giovani e talentuosi, che sono determinati a raggiungere l'obiettivo della promozione.