L'AGU Barnaul è una squadra di pallacanestro russa con sede a Barnaul, nell'Altaj Kraj, fondata nel 2002. Gioca nella Superleague 2, la seconda serie del campionato russo di pallacanestro.
Il club è stato fondato il 23 maggio 2002, con il nome di Barnaul, da un gruppo di imprenditori e appassionati di pallacanestro. La squadra ha debuttato nella Superleague 2 nella stagione 2002-2003, classificandosi al 16° posto. Nella stagione successiva, il team è stato promosso nella Superleague 1, ma è retrocesso dopo una sola stagione.
Nel 2006, il club ha cambiato nome in AGU Barnaul, dopo aver siglato un accordo di sponsorizzazione con l'Altaiskaya Gosudarstvennaya Universitet (Università statale di Altaj). Nella stagione 2007-2008, la squadra è tornata in Superleague 1, ma è retrocessa nuovamente dopo due stagioni.
Dalla stagione 2010-2011, l'AGU Barnaul gioca in Superleague 2, dove ha ottenuto buoni risultati, vincendo il campionato nel 2013-2014 e nel 2015-2016.
La squadra ha partecipato alla Coppa di Russia in diverse occasioni, ma non è mai riuscita a superare le prime fasi della competizione.
L'AGU Barnaul è una squadra giovane e ambiziosa, con l'obiettivo di tornare in Superleague 1 e affermarsi come una delle migliori squadre di pallacanestro russe.