L'FC Berdyansk è un club calcistico ucraino con sede nella città di Berdyansk. Fondato nel 1936, il club ha militato nelle divisioni inferiori del campionato ucraino fino al 1992, quando ha ottenuto la promozione in Perša Liha, la seconda divisione nazionale. L'FC Berdyansk ha giocato in Perša Liha per quattro stagioni, ottenendo il miglior risultato nel 1994-95, quando si è classificato terzo. Nella stagione 1995-96, il club è retrocesso in Druha Liha, la terza divisione nazionale. L'FC Berdyansk ha giocato in Druha Liha fino al 2002, quando è stato promosso nuovamente in Perša Liha. Il club ha giocato in Perša Liha per quattro stagioni, ottenendo il miglior risultato nel 2003-04, quando si è classificato quarto. Nella stagione 2005-06, l'FC Berdyansk è retrocesso nuovamente in Druha Liha. Il club ha giocato in Druha Liha fino al 2014, quando è stato promosso nuovamente in Perša Liha. L'FC Berdyansk ha giocato in Perša Liha per due stagioni, ottenendo il miglior risultato nel 2015-16, quando si è classificato quinto. Nella stagione 2016-17, il club è retrocesso nuovamente in Druha Liha. L'FC Berdyansk gioca le partite casalinghe allo stadio Berdyansk.